Protein–RNA interactions for Protein: Q96RF0

SNX18, Sorting nexin-18, humanhuman

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX18Q96RF0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
SNX18Q96RF0 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNX18Q96RF0 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms