Protein–RNA interactions for Protein: Q96NW7

LRRC7, Leucine-rich repeat-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC7Q96NW7 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRC7Q96NW7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms