Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
CCDC12Q8WUD4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CCDC12Q8WUD4 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms