Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CARMIL3Q8ND23 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms