Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 MTF2-202ENST00000370303 1951 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 Z82170.1-201ENST00000625081 3192 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 AC005324.3-201ENST00000455584 5514 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 NRP2-205ENST00000412873 2730 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 FFAR4-201ENST00000371481 3605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 POM121L4P-202ENST00000427789 1891 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 LINC01565-201ENST00000356020 2697 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 PDE8A-201ENST00000310298 3984 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 SLC20A2-208ENST00000520262 2992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
SMIM20Q8N5G0 MARVELD3-201ENST00000268485 2912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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