Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 CAMTA1-205ENST00000467404 546 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PROM2Q8N271 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
PROM2Q8N271 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms