Protein–RNA interactions for Protein: Q86WI1

PKHD1L1, Fibrocystin-L, humanhuman

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Length 4,243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1L1Q86WI1 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
PKHD1L1Q86WI1 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
PKHD1L1Q86WI1 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
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