Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEW1

ZCCHC12, Zinc finger CCHC domain-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC12Q6PEW1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
ZCCHC12Q6PEW1 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms