Protein–RNA interactions for Protein: Q63HK3

ZKSCAN2, Zinc finger protein with KRAB and SCAN domains 2, humanhuman

Predictions only

Length 967 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZKSCAN2Q63HK3 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ZKSCAN2Q63HK3 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms