Protein–RNA interactions for Protein: Q5JQC9

AKAP4, A-kinase anchor protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 854 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP4Q5JQC9 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
AKAP4Q5JQC9 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AKAP4Q5JQC9 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms