Protein–RNA interactions for Protein: Q58FG1

HSP90AA4P, Putative heat shock protein HSP 90-alpha A4, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA4PQ58FG1 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
HSP90AA4PQ58FG1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms