Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HSD17B12Q53GQ0 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HSD17B12Q53GQ0 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms