Protein–RNA interactions for Protein: Q499Y3

Putative uncharacterized protein C10orf88-like, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q499Y3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q499Y3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q499Y3 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q499Y3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q499Y3 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q499Y3 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Q499Y3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Q499Y3 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Q499Y3 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Q499Y3 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Q499Y3 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms