Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CLPPQ16740 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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