Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
HIST3H3Q16695 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms