Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
FSCN1Q16658 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms