Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PDK4Q16654 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
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