Protein–RNA interactions for Protein: Q16534

HLF, Hepatic leukemia factor, humanhuman

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLFQ16534 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
HLFQ16534 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HLFQ16534 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HLFQ16534 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HLFQ16534 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLFQ16534 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLFQ16534 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLFQ16534 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLFQ16534 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLFQ16534 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLFQ16534 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLFQ16534 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLFQ16534 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLFQ16534 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLFQ16534 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLFQ16534 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLFQ16534 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLFQ16534 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HLFQ16534 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms