Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
E2F4Q16254 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
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