Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TAF13Q15543 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms