Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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SEC23BQ15437 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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SEC23BQ15437 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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SEC23BQ15437 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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SEC23BQ15437 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
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SEC23BQ15437 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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SEC23BQ15437 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
SEC23BQ15437 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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