Protein–RNA interactions for Protein: Q15413

RYR3, Ryanodine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 4,870 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYR3Q15413 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
RYR3Q15413 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms