Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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NCAPHQ15003 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
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NCAPHQ15003 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
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NCAPHQ15003 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
NCAPHQ15003 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
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