Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC29.29■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC29.27■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC29.26■■■□□ 2.28
GAPVD1Q14C86 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
GAPVD1Q14C86 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
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