Protein–RNA interactions for Protein: Q14997

PSME4, Proteasome activator complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSME4Q14997 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSME4Q14997 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSME4Q14997 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms