Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.33■□□□□ 0.69
GPNMBQ14956 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
GPNMBQ14956 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
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