Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIDRQ14159 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIDRQ14159 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIDRQ14159 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIDRQ14159 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIDRQ14159 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIDRQ14159 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIDRQ14159 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIDRQ14159 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIDRQ14159 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIDRQ14159 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIDRQ14159 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
SPIDRQ14159 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPIDRQ14159 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
SPIDRQ14159 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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SPIDRQ14159 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
SPIDRQ14159 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
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