Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
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COL9A2Q14055 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
COL9A2Q14055 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
COL9A2Q14055 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
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