Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
DDX39BQ13838 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
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DDX39BQ13838 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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DDX39BQ13838 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
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DDX39BQ13838 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
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