Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
MSLNQ13421 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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