Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CLN3Q13286 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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