Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
CSTF3Q12996 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CSTF3Q12996 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
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