Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,538 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
HMGXB3Q12766 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC31.39■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC31.37■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
HMGXB3Q12766 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
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