Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF96

CGNL1, Cingulin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGNL1Q0VF96 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CGNL1Q0VF96 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
CGNL1Q0VF96 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.6 ms