Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NIPAL4Q0D2K0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms