Protein–RNA interactions for Protein: Q07092

COL16A1, Collagen alpha-1(XVI) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL16A1Q07092 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
COL16A1Q07092 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms