Protein–RNA interactions for Protein: Q06710

PAX8, Paired box protein Pax-8, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX8Q06710 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
PAX8Q06710 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms