Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GABPAQ06546 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms