Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
ERCC6Q03468 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC30.44■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
ERCC6Q03468 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms