Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC29.79■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
TOP2BQ02880 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC29.75■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
TOP2BQ02880 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC29.73■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms