Protein–RNA interactions for Protein: Q02809

PLOD1, Procollagen-lysine,2-oxoglutarate 5-dioxygenase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLOD1Q02809 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PLOD1Q02809 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
PLOD1Q02809 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms