Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
FGD1P98174 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
FGD1P98174 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
FGD1P98174 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
FGD1P98174 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms