Protein–RNA interactions for Protein: P78312

FAM193A, Protein FAM193A, humanhuman

Predictions only

Length 1,265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM193AP78312 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.58■□□□□ 0.73
FAM193AP78312 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
FAM193AP78312 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms