Protein–RNA interactions for Protein: P67870

CSNK2B, Casein kinase II subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK2BP67870 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CSNK2BP67870 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CSNK2BP67870 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms