Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
ACTG1P63261 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms