Protein–RNA interactions for Protein: P62736

ACTA2, Actin, aortic smooth muscle, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA2P62736 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
ACTA2P62736 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms