Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
RPS29P62273 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
RPS29P62273 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
RPS29P62273 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
RPS29P62273 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.6 ms