Protein–RNA interactions for Protein: P61960

UFM1, Ubiquitin-fold modifier 1, humanhuman

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFM1P61960 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFM1P61960 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFM1P61960 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFM1P61960 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFM1P61960 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFM1P61960 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
UFM1P61960 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
UFM1P61960 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms