Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AP3S2P59780 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AP3S2P59780 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms