Protein–RNA interactions for Protein: P53365

ARFIP2, Arfaptin-2, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFIP2P53365 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
ARFIP2P53365 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms